افرادی نا آگاه از دین گمان کرده اند که اختلاف فتوای مراجع تقلید همان بحث قرائت های مختلف از دین است، و از این رو، همان اشکالات را بر مراجع تقلید وارد کرده اند از این رو در ادامه تفاوت بین قرائت های مختلف از دین و اختلاف فتوای مراجع می پردازیم.
یکی از مسائل کلام جدید، بحث قرائت‌های مختلف از دین است و این که آیا از یک دین می توان قرائت های مختلفی استنباط کرد، این موضوع که از سوی اندیشمندان غربی و بر اساس شرایط خاص آن دوران مطرح شده بود، بعد از مدتی با آشنایی روشن فکران ما با کتب آنان، به دورن جامعه اسلامی ایران نیز کشیده شد و همان حرف ها را در مورد اسلام تکرار کردند.