علی مطهری به واسطه پدر شهیدش ایت‌الله مطهری وارد فضای سیاسی کشور شد و بسیاری او را به جای علی مطهری، فرزند مطهری خطاب می‌کردند و بر این باور بودند وی تمام اعتبارش را از پدرش بدست آورده است و خود به تنهایی دارای شخصیت مستقلی نیست
به گزارش تیک، ماجرای بازی ایران و کره در روز تاسوعا و اعتراض برخی از روحانیون و چهره‌های سیاسی باعث شد تا بازهم نام علی مطهری در سپهر سیاست ایران بدرخشد. در حالی که بسیاری از نمایندگان مجلس و اعضای دولت در برابر این اعتراض‌ها سکوت کردند بازهم این علی مطهری بود که به عنوان نماینده مردم وارد صحنه شد و از مردم و رعایت اخلاق اسلامی توسط آنها در روز تاسوعا و در ورزشگاه آزادی دفاع کرد.
او در پاسخ به سخنان آیت‌الله یزدی یکی از معترضین به این بازی گفته بود: